Химики РУДН показали, как новое противоопухолевое лекарство взаимодействует с белками крови
Гетероциклические соединения, в которых есть несколько органических «колец» с атомами других элементов, вызывают интерес химиков и фармацевтов благодаря широкому спектру биологической активности. Ранее в РУДН создали гетероциклическое соединение с выраженным противоопухолевым действием. По структуре оно напоминает препараты афтазол и панопрофен, которые обычно используют для борьбы с воспалениями. При этом механизм их действия не до конца известен ученым. Один из показателей эффективности препарата — его связывание с белками крови, поэтому изучение этого процесса важно для понимания работы препарата. Химики РУДН продолжили исследования нового препарата и изучили особенности его биофизического взаимодействия с организмом. Для этого они исследовали, как лекарство связывается с белком циклооксигеназой-1 (PTGS1) и бычьим сывороточным альбумином (BSA).
«Так как молекула созданного лекарственного соединения схожа с коммерческими препаратами пранопрофеном и афтазолом, интересно понять механизм его связывающего взаимодействия с PTGS1 с использованием различных биофизических методов. Понимание взаимодействия с BSA важно, потому что это хорошо известная модельная белковая молекула, которая может принимать различные лекарственные средства и переносить их к заданной молекулярной среде», — кандидат химических наук Алексей Феста, старший преподаватель кафедры органической химии РУДН.
Химики исследовали взаимодействие препарата с BSA и PTGS1 экспериментально и теоретически. Для этого они применили метод флуоресцентной спектроскопии (флуориметрии), а также компьютерное молекулярное моделирование. Флуориметрия позволяет определить концентрацию вещества по интенсивности флуоресценции, которая возникает при его облучении вещества.
Флуоресцентная спектроскопия показала, что при взаимодействии препарата с альбумином возникает эффект так называемого статического тушения. Это означает, что вещества соединились друг с другом, и получился нефлуоресцирующий продукт. Такой эффект (вместе с последующими результатами теоретического моделирования) говорит о том, что соединение идет по принципу гидрофобного взаимодействия. Оно определяет, как в результате будет выглядеть структура соединения. Молекулярное моделирование по методу молекулярного докинга показало, что в соединении с BSA и PTGS1 лекарство устойчиво в течение всего времени симуляции.
«Исследование молекулярного докинга показывает, что препарат обладает хорошей способностью к связыванию как в комплексе с BSA, так и в комплексе с PTGS. При этом теоретически рассчитанная энергия связи почти совпадает с рассчитанной экспериментально. Анализ молекулярной динамики показывает, что препарат стабилен как в комплексной системе с BSA, так и в системе с PTGS1», — Cубрамани Картикеан, постдок кафедры органической химии РУДН.
Результаты опубликованы в Journal of Molecular Structure.
Исследователи РУДН разработали инновационную систему «Челомер» для создания высокоточных трёхмерных моделей лица за считанные секунды. Проект, поддержанный акселератором RUDN.VC, уже вышел на стадию ранних продаж.
Представьте себе мир, где у каждого есть достаточно еды, чистая вода, доступ к образованию и достойная работа. Мир, где берегут природу и заботятся о будущем нашей планеты. Это и есть цели устойчивого развития — построить устойчивое будущее для всех! Для этого Организация Объединенных Наций (ООН) в 2015 году определила 17 Целей устойчивого развития (ЦУР). ЦУР — это глобальный план, который помогает странам и людям вместе двигаться к лучшему будущему. К нему присоединились 193 государства-члена ООН.
Исследователи факультета искусственного интеллекта РУДН провели масштабное исследование, которое раскрыло системные ошибки больших языковых моделей (LLM) при диагностике депрессии по тексту. Эта работа, выполненная совместно с коллегами из AIRI, ФИЦ ИУ РАН, ИСП РАН, МФТИ и MBZUAI, не только выявляет проблему, но и закладывает основу для создания более надёжных и безопасных инструментов для детектирования депрессии и тревожности.