Трансформация клеток и загадка с расчётами: студентка РУДН рассказала о январской Школе синтетической биологии в Новосибирске

Трансформация клеток и загадка с расчётами: студентка РУДН рассказала о январской Школе синтетической биологии в Новосибирске

В конце января в Новосибирском государственном университете во второй раз прошла январская Школа синтетической биологии и промышленной фармации. Образовательный интенсив собрал студентов со всей страны, готовых провести каникулы с пользой: освоить современные методы биоинформатики, поработать в лабораториях и пообщаться с лидерами фармацевтической индустрии.

В их числе была студентка 4‑го курса направления «Фармация» медицинского института РУДН Мария Гордеева.

На стыке биологии и цифры

Программа школы включала интенсивный курс по биоинформатике. Участники учились визуализировать структуры белков с помощью программ AlphaFold 3, PyMOL и Chai Discovery, строить филогенетические деревья (NCBI Datasets, MEGA12) и анализировать данные транскриптомики в RStudio (пакет DESeq2).

«Самым важным стало углубление уже полученных знаний, применение их на практике и освоение новых методик. Проведение молекулярного докинга на актуальном примере было очень полезно, учитывая важность цифровизации в современном мире. А самым сложным — систематизировать огромный поток информации, ведь программа охватывала и медицинские, и естественно-научные дисциплины. Но легко удавалось получить ответы от наставников и участников, которые всегда были готовы помочь», — Мария Гордеева.

Особый интерес у ребят вызвал разбор механизма действия препарата Нирматрелвир — ингибитора основной протеазы SARS-CoV-2. Студенты наглядно увидели, как молекула взаимодействует с вирусной мишенью.

Параллельно с теорией шла работа в лаборатории молекулярной биологии. Перед студентами стояла задача — провести трансформацию клеток дрожжей Komagataella phaffii, получив плазмиду с целевым геном и приготовив компетентные клетки. Результаты проверяли методом ПЦР в реальном времени (Q-PCR).

Фармацевтический кейс

На занятиях по промышленной фармации студенты полностью погрузились в будущую профессию. Им предложили задачу: по короткому описанию лечебного действия и ассоциациям определить загаданное лекарственное сырье, обосновать выбор, произвести расчеты и приготовить настой. Искомым растением оказалась душица обыкновенная.

Кроме того, каждый день в школе проходили лекции и встречи с представителями ведущих компаний: Helicon, «Диаэм», «ХимМед», «Фарма», «Р-Фарм», «Вектор-Бест», «ВкусВилл». Заместитель директора по научной работе ЦКП «СКИФ» Ян Зубавичус прочитал студентам лекцию о возможностях синхротронного излучения для биологии и фармацевтики.

«Каждый лектор делился уникальным опытом и давал советы по реализации в сфере фармации и биотехнологии. Такое общение бесценно для будущего специалиста», — Мария Гордеева.

Культурный акцент

Организаторы школы позаботились и о досуге ребят: они посетили Новосибирский государственный академический театр оперы и балета — крупнейший музыкальный театр России. Студенты увидели балет «Собор Парижской Богоматери».

«Великолепная архитектура, потрясающие декорации и артисты — это был настоящий подарок после интенсивных занятий», — Мария Гордеева.

Но главным итогом недельной работы в школе для студентки стало твердое намерение продолжать изучение биоинформатики.

«Я открыла для себя огромное желание полноценно освоить биоинформатику и применять полученные навыки в научной деятельности», — Мария Гордеева.

Новости
Все новости
Образование
10 сентября
Студентки ФИИ РУДН создали робота Gretchen на пятинедельной стажировке в Сеульском национальном университете

В конце июня студентки второго курса факультета искусственного интеллекта РУДН отправились в Сеул, где в течение пяти недель посещали летнюю школу в Сеульском национальном университете. Участницы выбрали курс «First Steps in Programming a Humanoid AI Robot», связанный с разработкой и программированием гуманоидных роботов с использованием технологий искусственного интеллекта.

Образование
4 сентября
ВШУ РУДН выпустила учебное пособие о цифровых финансовых активах

Высшая школа управления РУДН представила новое учебное пособие «Цифровые финансовые активы в современной экономике». Издание объединяет правовые, экономические и финансовые аспекты работы с цифровыми финансовыми активами (ЦФА) и предлагает системный взгляд на быстро развивающийся сегмент цифрового рынка.

Образование
1 сентября
«РУДН по любви»: как 198 школьников со всей России пробовали себя в медицине на Университетских сменах

В РУДН завершились две летние «Университетские смены» по направлению «Медицина». Этот масштабный образовательный проект даёт школьникам из десятков регионов России шанс заранее погрузиться в профессию врача и почувствовать настоящую студенческую жизнь.

Обе профильные смены — вторая и третья в летнем сезоне вуза — стали настоящим тест-драйвом для тех, кто планирует связать свою жизнь с медициной. Всего они собрали 198 старшеклассников из 73 регионов страны.