Трансформация клеток и загадка с расчётами: студентка РУДН рассказала о январской Школе синтетической биологии в Новосибирске
В конце января в Новосибирском государственном университете во второй раз прошла январская Школа синтетической биологии и промышленной фармации. Образовательный интенсив собрал студентов со всей страны, готовых провести каникулы с пользой: освоить современные методы биоинформатики, поработать в лабораториях и пообщаться с лидерами фармацевтической индустрии.
В их числе была студентка 4‑го курса направления «Фармация» медицинского института РУДН Мария Гордеева.
На стыке биологии и цифры
Программа школы включала интенсивный курс по биоинформатике. Участники учились визуализировать структуры белков с помощью программ AlphaFold 3, PyMOL и Chai Discovery, строить филогенетические деревья (NCBI Datasets, MEGA12) и анализировать данные транскриптомики в RStudio (пакет DESeq2).
«Самым важным стало углубление уже полученных знаний, применение их на практике и освоение новых методик. Проведение молекулярного докинга на актуальном примере было очень полезно, учитывая важность цифровизации в современном мире. А самым сложным — систематизировать огромный поток информации, ведь программа охватывала и медицинские, и естественно-научные дисциплины. Но легко удавалось получить ответы от наставников и участников, которые всегда были готовы помочь», — Мария Гордеева.
Особый интерес у ребят вызвал разбор механизма действия препарата Нирматрелвир — ингибитора основной протеазы SARS-CoV-2. Студенты наглядно увидели, как молекула взаимодействует с вирусной мишенью.
Параллельно с теорией шла работа в лаборатории молекулярной биологии. Перед студентами стояла задача — провести трансформацию клеток дрожжей Komagataella phaffii, получив плазмиду с целевым геном и приготовив компетентные клетки. Результаты проверяли методом ПЦР в реальном времени (Q-PCR).
Фармацевтический кейс
На занятиях по промышленной фармации студенты полностью погрузились в будущую профессию. Им предложили задачу: по короткому описанию лечебного действия и ассоциациям определить загаданное лекарственное сырье, обосновать выбор, произвести расчеты и приготовить настой. Искомым растением оказалась душица обыкновенная.
Кроме того, каждый день в школе проходили лекции и встречи с представителями ведущих компаний: Helicon, «Диаэм», «ХимМед», «Фарма», «Р-Фарм», «Вектор-Бест», «ВкусВилл». Заместитель директора по научной работе ЦКП «СКИФ» Ян Зубавичус прочитал студентам лекцию о возможностях синхротронного излучения для биологии и фармацевтики.
«Каждый лектор делился уникальным опытом и давал советы по реализации в сфере фармации и биотехнологии. Такое общение бесценно для будущего специалиста», — Мария Гордеева.
Культурный акцент
Организаторы школы позаботились и о досуге ребят: они посетили Новосибирский государственный академический театр оперы и балета — крупнейший музыкальный театр России. Студенты увидели балет «Собор Парижской Богоматери».
«Великолепная архитектура, потрясающие декорации и артисты — это был настоящий подарок после интенсивных занятий», — Мария Гордеева.
Но главным итогом недельной работы в школе для студентки стало твердое намерение продолжать изучение биоинформатики.
«Я открыла для себя огромное желание полноценно освоить биоинформатику и применять полученные навыки в научной деятельности», — Мария Гордеева.
Команда кафедры технологий строительства и конструкционных материалов РУДН показала высокие результаты в IX сезоне Всероссийской олимпиады студентов «Я — профессионал». По итогам финальных испытаний студенты инженерной академии завоевали золотую и серебряную медали, а также статус победителей по направлению «Строительство».
В начале мая состоялась ежегодная студенческая экспедиция на уникальный природный объект — Сарыкумские барханы в Дагестане. Мероприятие прошло под руководством доцентов департамента рационального природопользования Ольги Евгеньевны Полыновой и Дарьи Олеговны Капраловой. В этом году в полевых исследованиях приняли участие 10 студентов третьего курса, обучающихся по направлению «Экология и природопользование». Главная цель поездки была сугубо научной: будущие экологи собрали ценный материал для своих дипломных работ.
РУДН и компания «Хэдхантер» (hh.ru) подписали соглашение о расширении стратегического партнёрства в сфере ИТ-образования.
Сотрудничество развивается в рамках гранта Министерства цифрового развития РФ и Аналитического центра при Правительстве РФ на подготовку топ-специалистов в сфере искусственного интеллекта (проект «Топ-ИИ», программа бакалавриата факультета искусственного интеллекта «Искусственный интеллект: разработка и обучение интеллектуальных систем»). Новое соглашение открывает перед студентами целый ряд практических возможностей — от независимой оценки навыков до стажировок и менторства.