Трансформация клеток и загадка с расчётами: студентка РУДН рассказала о январской Школе синтетической биологии в Новосибирске
В конце января в Новосибирском государственном университете во второй раз прошла январская Школа синтетической биологии и промышленной фармации. Образовательный интенсив собрал студентов со всей страны, готовых провести каникулы с пользой: освоить современные методы биоинформатики, поработать в лабораториях и пообщаться с лидерами фармацевтической индустрии.
В их числе была студентка 4‑го курса направления «Фармация» медицинского института РУДН Мария Гордеева.
На стыке биологии и цифры
Программа школы включала интенсивный курс по биоинформатике. Участники учились визуализировать структуры белков с помощью программ AlphaFold 3, PyMOL и Chai Discovery, строить филогенетические деревья (NCBI Datasets, MEGA12) и анализировать данные транскриптомики в RStudio (пакет DESeq2).
«Самым важным стало углубление уже полученных знаний, применение их на практике и освоение новых методик. Проведение молекулярного докинга на актуальном примере было очень полезно, учитывая важность цифровизации в современном мире. А самым сложным — систематизировать огромный поток информации, ведь программа охватывала и медицинские, и естественно-научные дисциплины. Но легко удавалось получить ответы от наставников и участников, которые всегда были готовы помочь», — Мария Гордеева.
Особый интерес у ребят вызвал разбор механизма действия препарата Нирматрелвир — ингибитора основной протеазы SARS-CoV-2. Студенты наглядно увидели, как молекула взаимодействует с вирусной мишенью.
Параллельно с теорией шла работа в лаборатории молекулярной биологии. Перед студентами стояла задача — провести трансформацию клеток дрожжей Komagataella phaffii, получив плазмиду с целевым геном и приготовив компетентные клетки. Результаты проверяли методом ПЦР в реальном времени (Q-PCR).
Фармацевтический кейс
На занятиях по промышленной фармации студенты полностью погрузились в будущую профессию. Им предложили задачу: по короткому описанию лечебного действия и ассоциациям определить загаданное лекарственное сырье, обосновать выбор, произвести расчеты и приготовить настой. Искомым растением оказалась душица обыкновенная.
Кроме того, каждый день в школе проходили лекции и встречи с представителями ведущих компаний: Helicon, «Диаэм», «ХимМед», «Фарма», «Р-Фарм», «Вектор-Бест», «ВкусВилл». Заместитель директора по научной работе ЦКП «СКИФ» Ян Зубавичус прочитал студентам лекцию о возможностях синхротронного излучения для биологии и фармацевтики.
«Каждый лектор делился уникальным опытом и давал советы по реализации в сфере фармации и биотехнологии. Такое общение бесценно для будущего специалиста», — Мария Гордеева.
Культурный акцент
Организаторы школы позаботились и о досуге ребят: они посетили Новосибирский государственный академический театр оперы и балета — крупнейший музыкальный театр России. Студенты увидели балет «Собор Парижской Богоматери».
«Великолепная архитектура, потрясающие декорации и артисты — это был настоящий подарок после интенсивных занятий», — Мария Гордеева.
Но главным итогом недельной работы в школе для студентки стало твердое намерение продолжать изучение биоинформатики.
«Я открыла для себя огромное желание полноценно освоить биоинформатику и применять полученные навыки в научной деятельности», — Мария Гордеева.
В полуфинал XII Всероссийского инженерного конкурса (ВИК) вышли пять студентов инженерной академии РУДН. В этом году для участия в состязании было подано рекордное количество заявок — 13 498. Все они прошли оценку отраслевых экспертов. По итогам отбора в полуфинал попали 898 студентов из 126 российских вузов.
Ведущий системный интегратор в сфере информационной безопасности АО «Цикада» и РУДН заключили соглашение о стратегическом партнёрстве.
Под руководством старшего преподавателя Сергея Ивановича Черткова третьекурсники РУДН, будущие архитекторы, побывали в действующей пожарной части. Экскурсия стала ключевым этапом работы над учебными проектами современного пожарного депо, позволив будущим архитекторам совместить теоретические знания с реальными требованиями к объекту.